2005年9月12日，郑州铁路局与郑州大学签署《关于将郑州铁路局中心医院移交郑州大学的协议》，医院更名为郑州大学第五附属医院。从此，医院由为铁路职工服务为主的企业医院转变为面向社会为广大人民群众服务的社会性医院，职能由医疗保健为主转变为医疗、教学、科研三位一体的大学附属医院。

▲ 2005年9月12日，代表郑州铁路局的时任局长徐宜发（右）与代表郑州大学的时任校长申长雨（左）签署移交协议，医院更名为郑州大学第五附属医院

       2005年10月26日，医院举行郑州大学第五附属医院揭牌暨建院90周年庆典，这是医院发展史上的一座重要里程碑，是一个崭新纪元的开端。在过去九十年中，医院与广大铁路职工、家属同呼吸共命运，伴随着铁路的发展而壮大，成为一家集医疗、科研、教学、康复、预防、急救为一体，汇“三级甲等医院”、“全国百佳医院”和“全国百姓放心示范医院”为一身的大型综合医院。如今，医院的社会职能整体移交，医院定位虽然变了，但是医院“以人为本、以德为先、患者至上、诚信关爱”的宗旨不会变；“一切以病人为中心、为病人提供优质满意服务”的主题不会变；为铁路运输生产及职工家属服务的理念不会变；在成为大学附属医院后与时俱进共谋发展的决心不会变。今后，郑州大学第五附属医院将依托郑州大学教育资源优势，为全省人民提供更加优质的医疗服务，努力开创医院更加辉煌的明天！

▲ 2005年10月26日，医院抓住移交的机遇举办了揭牌暨建院九十周年庆典

       2009年12月16日，医院编制问题圆满解决，河南省人民政府正式发文《河南省人民政府关于调整郑州大学第五附属医院为卫生事业差供单位的批复》（豫政文[2009]371号）批复医院为卫生事业差供单位，正式成为卫生事业单位。2010年2月23日，临床学院设置通过专家组论证，郑州大学发文《关于设立郑州大学第五临床学院及其党组织的通知》（郑大党文[2010]5号），郑州大学第五临床学院获批。

▲ 郑州大学第五临床学院设置通过专家论证